Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Frg2f1Q6P3A2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frg2f1Q6P3A2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms