Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms