Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms