Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Colgalt2Q6NVG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms