Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms