Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SphkapQ6NSW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms