Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms