Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mvb12bQ6KAU4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mvb12bQ6KAU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms