Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q66JV7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q66JV7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q66JV7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q66JV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q66JV7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q66JV7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q66JV7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q66JV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q66JV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q66JV7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms