Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ca4Q64444 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms