Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpegQ62407 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpegQ62407 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpegQ62407 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpegQ62407 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms