Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SspnQ62147 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SspnQ62147 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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