Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PtprrQ62132 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprrQ62132 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprrQ62132 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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