Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prm3Q62100 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Prm3Q62100 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Prm3Q62100 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Prm3Q62100 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Prm3Q62100 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prm3Q62100 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prm3Q62100 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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