Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hes3Q61657 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Hes3Q61657 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hes3Q61657 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes3Q61657 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms