Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1aQ61180 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1aQ61180 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1aQ61180 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms