Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JrkQ60976 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms