Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf4Q60793 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf4Q60793 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms