Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfkbibQ60778 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbibQ60778 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms