Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Akap4Q60662 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap4Q60662 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap4Q60662 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap4Q60662 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap4Q60662 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms