Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TefmQ5SSK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms