Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp18Q5SSI6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp18Q5SSI6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms