Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam46cQ5SSF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms