Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms