Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm3Q5F4S9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm3Q5F4S9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms