Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp22Q5DU02 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp22Q5DU02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms