Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f8Q58FA4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms