Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccnl1Q52KE7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnl1Q52KE7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms