Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk4Q3V129 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms