Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chpf2Q3UU43 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chpf2Q3UU43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms