Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B230104I21RikQ3USW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms