Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms