Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ell2Q3UKU1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms