Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul4aQ3TCH7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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