Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY0

Igfn1, Immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfn1Q3KNY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Igfn1Q3KNY0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igfn1Q3KNY0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms