Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psd3Q2PFD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psd3Q2PFD7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms