Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1aQ2LKU9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms