Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VgfQ0VGU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms