Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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