Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a1Q09143 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms