Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q08AU9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q08AU9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q08AU9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q08AU9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q08AU9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q08AU9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q08AU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q08AU9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms