Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah1bQ06985 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms