Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mmp11Q02853 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms