Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms