Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mc1rQ01727 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms