Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabpaQ00422 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms