Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms