Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms