Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms