Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rit1P70426 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rit1P70426 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms